2005年度温州市机关档案工作目标管理市一级认定单位；

市局“温州市商业银行2003至2004年度资产负债损益审计”和“温州本级住房公积金及其他住房资金审计调查”项目被省厅评为2005年度计算机审计项目应用奖；市局“会计核算中心辅助审计软件”被省厅评为2005年度“三小”审计软件二等奖，乐清市审计局“温州审计伴侣”和“救灾资金联网审计小软件”被评为三等奖；

2005年度全省审计信息工作先进单位；

市直机关计划生育工作先进集体；

2005年度市直机关（单位）党建工作目标管理检查考核成绩优秀单位；

2004-2005年度市直机关党建工作先进单位；

被《中国审计》编辑部评为2006年度审计宣传工作先进单位；

被《中国审计报》社评为2006年度通联宣传工作优秀单位；

反映温州审计机关二十年主要工作及成效的《温州审计》一书（中国时代经济出版社2004年7月出版）获温州市第十届哲学社会科学优秀成果著作类优秀奖；

2006年度市级档案工作优秀单位；

2006年度全省内部审计业务指导和监督工作二等奖。